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三白草科 Saururaceae
三白草 Saururus chinensis (Lour.) Baill
蕺菜 Houttuynia cordataThunb

小二仙草科 Haloragaceae
小二仙草 Haloragis micrantha (Thunb.) R.Br.ex Sieb. & Zucc.

小檗科 Berberidaceae
八角蓮 Dysosma pleiantha (Hance) Woodson

山柑科 Capparaceae
白花菜 Cleome gynandra L.
平伏莖白花菜 Cleome rutidosperma DC
向天黃 Cleome viscose L.

毛茛科 Ranunculaceae
台灣烏頭 Aconitum fukutomei Hayata var. fukutomei
小白頭翁 Anemone vitifolia Buch-Ham. ex DC
串鼻龍 Clematis grata Wall
蓬萊毛茛 Ranunculus Formosa-montanus Ohwi

天南星科 Araceae
長行天南星 Arisaema consanguineum Schott
台灣天南星 Arisaema formosanum (Hayata)
羽葉天南星 Arisaema heterophyllum Blume
宜蘭天南星 Arisaema ilanense J. C. Wang
申跋 Arisaema ringens (Thunb.) Schott
蓬萊天南星 Arisaema taiwanense J. Murata
半夏 Pinellia ternate (Thumb.) Breit
大萍 Pistia stratiotes L.
土半夏 Typhonium blumei Nicolson & Sivadasan

石竹科 Caryophyllaceae
阿里山卷耳 Cerastium arisanensis Hayata
玉山卷耳 Cerastium trigynum Vill.var. morrisonense (Hayata)
狗筋蔓 Cucubalus baccifer L.
玉山石竹 Dianthus pygmaeus Hayata

玄參科 Scrophulariaceae
毛地黃 Digitalis purpurea L.
海螺菊 Ellisiophyllum pinnatum (Wall. ex Benth.) Makino
玉山小米草 Euphrasia transmorrisonensis Hayata
腰只花 Hemiphragma heterophyllum Wall
紫蘇草 Limnophila aromatica (Lam.) Merr.
泥花草 Lindernia antipoda (L.) Alston
旱田草 Lindernia ruelloides(Colsm) Pennell
馬先蒿 Pedicularis verticillata L.
倒地蜈蚣 Torenia concolor Lindl.
母丁香 Torenia flava Buch-ham. ex Benth.
爪哇水苦□ Veronica javanica Bl.
玉山水苦□ Veronica morrisonicola Hayata
毛蟲婆婆納 Veronica peregrina L.
阿拉伯婆婆納 Veronica persica Poir
新竹腹水草 Veronicastrum axillare

當科 Orobanchaceae
野菇 Aeginetia indica L.

百合科 Liliaceae
綿棗兒 Barnardia japonica (Thunb.) Schultes & J.H. Schultes
萬年青 Campylandra chinensis (Baker)M.N. Tamura
文殊蘭 Crinum asiaticum L.
狹葉七葉一枝花 Daiswa bockiana (Diels) Takht
華七葉一枝花 Daiswa chinensis (Franch) Takht
桔梗蘭 Dianella ensifolia (L.) Redoute
阿里山假寶鐸花 Disporopsis arisanensis Hayata
台灣寶鐸花 Disporum cantoniense (Lour.) var. Kawakamii (hayata)
山寶鐸花 Disporum sessile D.Don ex Schultes var. shimadai (Hayata)
台灣胡麻花 Heloniopsis umbellate Baker
橙萱 Hemerocallis fulva L. var. aurantiacea (Baker) Hotta
螫蟹花 Hymenocallis speciosa (L.f. ex Salisb.) Salisb.
小金梅草 Hypoxis aureal Lour.
台灣百合 Lilium longiflorum Thunb. var. formorsanum
粗莖麝香百合 Lilium longiflorum Thunb.var. scabrum Masamune
艷紅百合 Lilium speciosum Thunb. var. gloriosoides Baker
龍爪花 Lycoris aurea Herb.
鹿藥 Maianthemum formosanum (Hayata) LaFrankie
船子草 Molineria capitulate (Lour.)Herb.
萎□ Polygonatum arisanense Hayata

虎耳草科 Saxifragaceae
落新婦 Astilbe longicarpa (Hayata) Hayata
台灣嗩吶草 Mitella formosana (Hayata) Masamune
梅花草 Parnassia palustris L.

岩梅科 Diapensiaceae
倒卵葉裂緣花 Shortia rotundifolia (Maxim.)Makino

雨久花科 Pontederiaceae
布袋蓮 Eichhornia crassipes (Mart.) Solms
鴨舌草 Monochoria vaginalis (Burm. f.)Presl

金粟蘭科 Chloranthaceae
台灣及己 Chloranthus oldhamii Solms.
紅果金粟蘭 Sacandra grabra(Thunb.)

金絲桃科 Guttiferae
地耳草 Hypericum japonicum Thunb.ex Murray
玉山金絲桃 Hypericum nagasawae Hayata
元寶草 Hypericum sampsonii Hance
無柄金絲桃 Hypericum taihezanense Sasaki

茄科 Solanaceae
雙花龍葵 Lycianthes bifloram(Lour) Bitter
蔓茄 Lycianthes lysimachioides (Wall.)Bitter
皺葉煙草 Nicotiana plumbaginiflora Viviani
菸草 Nicotiana tabacum L.
燈籠草 Physalis angulata L.
秘魯苦蘵 Physalis peruviana L.
白英 Solanum lyrantum Thunb.
宮古茄 Solanum miyakojimense Yamazaki & Takusi
玉山茄 Solanum pittosporifolium Hemsl.
珊瑚櫻 Solanum pseudocapsicum L.
印度茄 Solanum violanceum Ortega
龍珠 Tubocapsicum anomalum Makino

茅膏菜科 Droseraceae
小茅氈苔 Drosera spathulata Lab

苦苣苔科 Gesneriaceae
角桐草 Hemiboea bicornuta (Hayata) Ohwi
同蕊草 Rhynchotechum discolor (Maxim.)Burtt
蓬萊同蕊草 Rhynchotechum formosanum Hatusima
俄氏草 Titanotrichum oldhamii (Hemsl.) Solereder
玉玲花 Whytockia sasakii (Hayata) Burtt

柳葉菜科 Onagraceae
黑龍江柳葉菜 Epilobium amurense Hausskn. subsp. Amurense
合歡柳葉菜 Epilobium hohuanense Ying ex Chen，Hoch & Raven
白花水龍 Ludwigia adscendens (L.) Hara
台灣水龍 Ludwigia x taiwanensis Peng
細葉水丁香 Ludwigia hyssopifolia (G. Don) Exell
水丁香 Ludwigia octovalvis (Jacq.) Raven
黃花月見草 Oenothera glazioviana Micheli
裂葉月見草 Oenothera lacinita J.Hill
待宵草 Oenothera stricta Ledeb. ex link

馬兜鈴科 Aristolochiaceae
瓜葉馬兜鈴 Aristolochia cucurbitifolia Hayata
異葉馬兜鈴 Aristolochia heterophylla Hemsl.
大葉馬兜鈴 Aristolochia Kaempferi Willd.
薄葉細辛 Asarum caudigerum Hance
大花細辛 Asarum macranthum Hook. f.

馬鞭草科 Verbenaceae
馬櫻丹 Lantna camara L.
鴨舌□ Phyla nodiflora (L.) Greene
長穗木 Stachytarpheta jamaicensis (L.) Vahl
柳葉馬鞭草 Verbena bonariensis L.
馬鞭草 Verbena officinalis L.

桔梗科 Campanulaceae
高山沙參 Adenophora morrisonensis Hayata subsp. Uehatae
輪葉沙參 Adenophora triphylla (Thunb.) A.DC.
玉山山奶草 Codonopsis kawakamii Hayata
台灣土黨參 Cyclocodon lancifolius (Roxb.) Kurz
半邊蓮 Lobelia chinensis Lour.
普拉特草 Lobelia nummularia Lam.
圓葉山梗菜 Lobelia zeylanica L.
山桔梗 Peracarpa carnosa (Wall.) Hook.f. & Thomson
細葉蘭花參 Wahlenbergia marginata (Thunb.) A.DC.

茜草科 Rubiaceae
小牙草 Dentella repens
刺果豬殃殃 Galium echinocarpum Hayata
琉球豬殃殃 Galium gracilens (A.Gray)Makino
苞花蔓 Geophila herbacea (Jacq.) Kuntze
繖花龍吐珠 Hedyotis corymbosa (L.) Lam.
定經草 Hedyotis diffusa Willd.
台灣新耳草 Neanotis formosana Hayata
涼喉茶 Neanotis hirsute (L.) W.H.Lewis
深柱夢草 Nertera granadense (Mutis ex L.f.) Druce
早田氏蛇根草 Ophiorrhiza hayatana Ohwi.
蛇根草 Ophiorrhiza japonica Bl.
小花蛇根草 Ophiorrhiza kuroiwae Makino
白花蛇根草 Ophiorrhiza pumila Champ. ex Benth.

唇形科 Labiatae
毛藥花 Bostrychanthera deflexa Benth.
小鞘蕊草 Coleus pumilus
金錢薄荷 Glechoma hederacea L. var. grandis (A.Gray) Kudo
塊莖小野芝麻 Lamium tuberferum (Makino)Ohwi
白花草 Leucas chinensis (Retz.) R.Br.
薄荷 Mentha arvensis L.
仙草 Mesona procumbens Hemsley
乾汗草 Mosla chinensis Maxim
石薺薴 Mosla scabra (Thunb.) Wu & Li
羅勒 Ocimum basilicum L.
美羅勒 Ocimum gratissimum L.
野薄荷 Origanum vulgare L.
夏枯草 Prunella vulgaris L.var. asiatica(Nakai) Hara .
紅花鼠尾草 Salvia coccinea Juss. Ex Murr.
日本紫花鼠尾草 Salvia japonica Thunb. ex Murray
黃花鼠尾草 Salvia niponica Miq. var.formosana (Hayata) Kudo
早田氏鼠尾草 Salvia hayatana Makino ex Hayata
卵葉鼠尾草 Salvia scapiformis Hance
向天盞 Scutellaria barbata D.Don

牻牛兒苗科 Gernaniaceae
單花牻牛兒苗 Gernanium Hayatanum Ohwi
牻牛兒苗 Gernanium nepalense Sweet subsp.thunbergii Hara
漢紅魚腥草 Geranium robertianum L.
山牻牛兒苗 Geranium suzukii Masamune
老鸛草 Geranium wilfordii Maxim

野牡丹科 Melastomataceae
肉穗野牡丹 Sarcopyramis napalensis Wall. var. bodinieri Levl.
東方肉穗野牡丹 Sarcopyramis var.delicate(C.B. Robinson)

鹿蹄草科 Pyrolaceae
水晶蘭 Cheilotheca humilis (D.Don) H.Keng
阿里山水晶蘭 Cheilotheca macrocarpa (Andres) Y.L. Chou
班紋鹿蹄草 Pyrola albo-reticulata Hayata
玉山鹿蹄草 Pyrola morrisonensis Hayata

蛇菇科 Balanophoraceae
穗花蛇菇 Balanophora laxiflora Hemsl.

旋花科 Convolvulaceae
馬蹄金 Dichondra micrantha Urban
土丁桂 Evolvulus alsinoides L.

無患子科 Sapindaceae
倒地鈴 Cardiospermum halicacabum L.

報春花科 Primulaceae
琉璃繁縷 Anagalis arvensis L.
點地梅(地錢草) Androsace umbellate Lour.
台灣排香 Lysimachia ardisioides Masam
排香草 Lysimachia capillipes Hemsl.
小茄 Lysimachia japonica Thunb.
蓬萊珍珠菜 Lysimachia remota Petitm.
台灣珍珠菜 Lysimachia congestiflora Hemsl.

紫草科 Boraginaceae
琉璃草 Cynoglossum furcatum Wall.
小花倒提壺 Cynoglossum lanceolatum Forssk
山豆根 Heliotropium formosanum I.M. Johnst.
狗尾草 Heliotropium indicum L.
伏毛天芹菜 Heliotropium procumbens Mill. var. depressum (Cham.)
康復力 Symphytum officinate Linn.
盾果草 Thyrocarpus sampsonii Hance
台北附地草 Trigonotis elevatovenosa Hayata
台灣附地草 Trigonotis formosana Hayata

遠志科 Polygalaceae
瓜子金 Polygala japonica Houtt
圓錐花遠志 Polygala paniculata L.
小扁豆 Polygala tatarinowii-Regel

鳶尾科 Iridaceae
射干 Belamcanda chinensis (L.) DC.
射干菖蒲 Crocosmia crocosmiflora (Nichols) N.E. brdwn
台灣鳶尾 Iris formosana Ohwi
日本鳶尾 Iris japonica
巴西鳶尾 Neomarica northiana T. Strague
黃花庭昌蒲 Sisyrinchium exile E.P. Bicken.
鳶尾葉庭菖蒲 Sisyrinchium iridifolium Kunth
鳳仙花 Balsaminaceae
棣慕華鳳仙花 Impatiens devolii Huang
黃花鳳仙花 Impatiens tayenmoni Hayata
紫花鳳仙花 Impatiens uniflora Hayata

龍膽科 Gentianaceae
百金 Centaurium japonicum (Maxim.) Druce
阿里山龍膽 Gentiana arisanensis Hayata
台灣龍膽 Gentiana davidii Franch. var. formosana(Hayata) T.N.Ho
黃斑龍膽 Gentiana flavomaculata Hayata
高山龍膽 Gentiana horaimontana Masam.
黑斑龍膽 Gentiana scabrida Hayata var. punctulata S.S.Ying
新店當藥 Swertia shintenensis Hayata
巒大當藥 Swertia macrosperma C.BClarke
高山當藥 Swertia tozanensis Hayata
台北肺形草 Tripterospermum alutaceifolium J.Murata
台灣肺形草 Tripterospermum taiwanense (Masam) Satake
玉山肺形草 Tripterospermum lanceolatum (hayata) Hara ex Satake

薑科 Zingiberaceae
山薑 Alpinia japonica(Thunb.) Miq.
閉鞘薑 Costus speciosus (Koenig) Smith
薑黃 Curcuma domestica Valet
穗花山奈 Hedychium coronarium Koenig
三奈 Zingiber kawagoii Hayata

爵床 Acanthaceae
穿心蓮 Andrographis paniculata
尼氏擬馬偕花 Asysstaiella nesiana (S.Moore) E.Hossain
針刺草 Codonacanthus pauciflorus (Nees)
華九頭獅子草 Dicliptera chinensis (L.) Juss
恆春半插花 Hemigraphis primulifolia (Nees) F.-Vill.
大安水蓑衣 Hygrophila pogonocaly x Hayata
六角英 Hypoestes purpurea R.Br.
早田氏爵床 Justicial procumbens L. var. hayata
爵床 Justicial procumbens
台灣麟球花 Lepidagathis formosensis Clarke ex Hayata
九頭獅子草 Peristrophe japonica (Thunb.) Bremek
山藍 Peristrophe roxburghiana (Schult) Bremek
匐蘆利草 Ruellia prostrate Poir
台灣明萼草 Rungia taiwanensis Yamazaki
哈哼花 Staurogyne concinnula (Hance) O.Ktze
馬藍 Strobilanthes cusia (Nees) Kuntze
曲莖馬藍 Strobilanthes flexicaulis Hayata
台灣馬藍 Strobilanthes formosanus Moore
腺萼馬藍 Strobilanthes penstemonoides T. Andrers
蘭坎馬藍 Strobilanthes rankanensis Hayata
黑眼花 Thunbergia alata
大鄧柏花 Thunbergia grandiflora
白眼花 Thunbergia gregorii

薔薇科 Rosaceae
龍牙草 Agrimonia pilosa Ledeb.
台灣蛇莓 Duchesnea chrysantha (Zoll. & Mor.)Miq
蛇莓 Duchesnea indica (Andr.)Focke
台灣草莓 Fragaria hayatai Makino
翻白草 Potentilla discolor Bunge
玉山金梅 Potentilla leuconota D.Don
高山翻白草 Potentilla matsumurae Th. Wolf. var.pilosa Koidz